АвтоАвтоматизацияАрхитектураАстрономияАудитБиологияБухгалтерияВоенное делоГенетикаГеографияГеологияГосударствоДомДругоеЖурналистика и СМИИзобретательствоИностранные языкиИнформатикаИскусствоИсторияКомпьютерыКулинарияКультураЛексикологияЛитератураЛогикаМаркетингМатематикаМашиностроениеМедицинаМенеджментМеталлы и СваркаМеханикаМузыкаНаселениеОбразованиеОхрана безопасности жизниОхрана ТрудаПедагогикаПолитикаПравоПриборостроениеПрограммированиеПроизводствоПромышленностьПсихологияРадиоРегилияСвязьСоциологияСпортСтандартизацияСтроительствоТехнологииТорговляТуризмФизикаФизиологияФилософияФинансыХимияХозяйствоЦеннообразованиеЧерчениеЭкологияЭконометрикаЭкономикаЭлектроникаЮриспунденкция

Тривиальная номенклатура ферментов

Читайте также:
  1. Будова, ізомерія, номенклатура альдегідів та кетонів
  2. Будова, ізомерія, номенклатура ненасичених карбонових кислот
  3. Будова, номенклатура, ізомерія амінокислот
  4. В нашей организации не утверждена номенклатура дел. Как мы должны отбирать документы к уничтожению?
  5. Важнейшие классы неорганических соединений. Бинарные и многоэлементные соединения. Оксиды: определение, классификация, номенклатура, способы получения, химические свойства
  6. Вы советуете в качестве источника ферментов употреблять все сырые продукты?
  7. З.Термолабильность ферментов
  8. Загальна характеристика амінів, їх будова, номенклатура, ізомерія
  9. Значение ферментов
  10. Инактивация ферментов
  11. Использование ингибиторов ферментов
  12. Использование ферментов в клинической диагностике

Историческая справка.Современная функциональная классификация и номенклатура ферментов предложены Международной комиссией по ферментам в 1961 г. Согласно этой классификации все ферменты подразделяются на 6 классов:

1. Оксидоредуктазы,

2. Трансферазы,

3. Гидролазы,

4. Лиазы,

5. Изомеразы,

6. Лигазы (синтетазы).

Каждый класс содержит несколько подклассов – в первом классе 17 классов, во втором – 8, третьем – 11, четвертом – 7, пятом – 6 и шестом – 5 подклассов.

Каждый фермент имеет 4-значный код, который обозначает:

· первое число – номер класса, к которому относится данный фермент,

· второе число обозначает подкласс,

· третье число – номер подподкласса,

· четвертое – порядковый номер фермента в подподклассе.

Таким образом, КФ 2.7.1.1. означает, что фермент относится к классу 2 (трансфераза), подклассу 7 (перенос фосфата) и подподклассу 1 (акцептором фосфата является спиртовая группа). Последняя цифра фермента обозначает гексокиназу, или АТФ: D-гекзсозо-6-фосфотрансферазу, т.е. фермент, катализирующий перенос фосфата с АТФ на гидроксильную группу атома углерода в шестом положении глюкозы:

На примере нескольких ферментов, рассмотрим принципы формирования тривиального (или рабочего) названия ферментов.

1. Дегидрогеназыотносятся к классу оксидоредуктаз (КФ 1.1.1.), катализируют:

· окислительно-восстановительные реакции, т.е. отнятия и присоединения (±) 2Н,

· фермент катализирует как прямую, так и обратную реакции ( ).

Название состоит из 2 частей:

1) название субстрата, который является донором 2Н (из двух соединений выбирается то, от которого отнимается 2 атома водорода);

2) + «дегидрогеназа».

Например, окисление сукцината в фумарат:

сукцинат фумарат

Так как в этой реакции происходит дегидрирование сукцината, фермент называется сукцинатдегидрогеназой, или сокращенно СДГ.

 

2. Гидратазы –относятся к классу лиаз (КФ 4.2.1.), катализируют:

· реакции гидратации и дегидратации (± Н2О),

· фермент катализирует как прямую, так и обратную реакции ( ).

Название состоит из 2 частей:

1) название субстрата, к которому присоединяется Н2О (обычно содержит двойную связь, так как присоединение воды происходит по месту разрыва двойной связи),



2) + «гидратаза».

Например, гидратация фумарата:

 

фумарат малат

Из двух соединений выбирают то, которое содержит двойную связь в углеродной цепочке (фумарат) + слово «гидратаза», следовательно, полное название фермента – фумаратгидратаза.

3. Киназы –относятся к классу трансфераз (КФ 2.7.1), катализируют реакции фосфорилирования субстратов с затратами или образованием АТФ; все реакции, в которых участвуют киназы, практически необратимы.

Название состоит из 2 частей:

1) название субстрата, который фосфорилируется,

2) + «киназа».

Необходимо помнить, чтоглюкозу фосфорилируют2 фермента – гексокиназа и глюкокиназа, и всегдапо 6-му атому углерода,а фруктозу и галактозупо 1-му,ферменты соответственно называются фруктокиназа и галактокиназа. Гексокиназа при очень больших концентрациях фруктозы и галактозы (при патологии) может фосфорилировать эти гексозы (в норме этого не происходит), в этом случае присоединение фосфатной группы осуществляется по 6-му атому углерода.

Примеры:

1. Фосфорилирование глюкозы:

глюкоза глюкозо-6-фосфат

 

2.Фосфорилирование галактозы галактокиназой:

3.Фосфорилирование фруктозы фруктокиназой:

 

4. Изомеразы – относятся к 5-му классу, катализируют реакции взаимопревращения различных изомеров. Рассмотрим номенклатуру некоторых подклассов изомераз – мутаз, изомераз и эпимераз. Следует помнить, что все реакции, катализируемые изомеразами, обратимы.

4.1. Мутазы – катализируют реакции внутримолекулярного переноса заместителей (например, фосфатной группы от 6-го к 1-му атому углерода в молекуле глюкозы).

Название состоит из 3 частей:

1) название транспортируемой группы (фосфо-),

2) название субстрата (глюко-),

3) + «мутаза».

Пример –взаимопревращение глюкозо-6-фосфата в глюкозо-1-фосфат:

Так как в этой реакции происходит перенос фосфатной группы от 6-го к 1-му атому углерода в глюкозе, полное название фермента будет фосфоглюкомутаза.

‡агрузка...

4.2. Изомеразы– катализируют реакции взаимопревращения альдоз и кетоз:

Название также состоит из 3 частей:

1) общее название двух изомеров (по количеству атомов углерода в моносахариде – гексозо-, пентозо-, тетрозо- и триозо-),

2) название заместителя, если он имеется,

3) + «изомераза».

Например, взаимопревращение диоксиацетонфосфата и глицераль-дегид-3-фосфата:

 

диоксиацетонфосфат глицеральдегид-3-фосфат

 

Необходимо помнить, что глюкоза и фруктоза и их производные в клетке находятся в циклической форме, и их взаимопревращение также катализируют изомеразы. Например, превращение глюкозо-6-фосфата во фруктозо-6-фосфат:

глюкозо-6-фосфат фруктозо-6-фосфат

4.3. Эпимеразы– катализируют взаимопревращение эпимеров (изомеров, которые отличаются между собой расположением заместителей у одного и того же атома углерода).

Название состоит из 3 частей:

1) общее название двух изомеров (обычно по количеству атомов углерода в моносахариде – гексозо-, пентозо-, тетрозо- и триозо-),

2) название заместителя, если он имеется,

3) + «эпимераза» с цифрой, обозначающей порядковый номер атома углерода (например, эпимераза-3).

Например, взаимопревращение рибулозо-5-фосфата и ксилулозо-5-фосфата:

рибулозо-5-фосфат ксилулозо-5-фосфат

 

Эти 2 соединения отличаются между собой расположением заместителей у 3-го атома углерода, следовательно, полное название фермента, катализирующего эту реакцию, пентозо-5-фосфат-эпимераза-3.

 


1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 |


При использовании материала, поставите ссылку на Студалл.Орг (0.019 сек.)