Ошибки, встречающиеся при проведении ПЦР-диагностики

· Контаминация пробы на стадии отбора материала

· Загрязнение пробы примесями, ингибирующими ПЦР

· Отбор материала выполнен неадекватно, в пробе отсутствуют клеточные структуры.

· Разрушение ДНК при транспортировке и хранении пробы

· Потери ДНК во время пробоподготовки

· Контаминация в отдельных пробах

· Тотальная контаминация

Достоинства ПЦР – анализа:

· Высокая скорость

· Высокая производительность

· Высокая чувствительность и специфичность

· Эффективность в отношении диагностики медленно растущих и некультивируемых микроорганизмов

Недостатки ПЦР – анализа:

· Узкая направленность (нужно предполагать возбудителя).

· Проблема контаминации – строгий режим постановки.

· Наличие ингибиторов (гепарин при анализе крови).

· Не всегда подходит для контроля после лечения (Обнаруживают как живых, так и умерших м/о), не раньше, чем через 1 месяц.

Открытие вирусов, основы классификации

Вирусология -наука о вирусах (син. вирусные частицы, вирионы, вироспоры). Вирус – яд (с греч.)

· Вирусы- микроорганизмы, неклеточные формы жизни

Дмитрий Иосифович Ивановский

· 1892 – фильтрующийся вирус растений – вирус табачной мозаики

· 1896 -первый вирус человека и животных

o вирус ящура род Aphthovirus,

· сем. Picornaviridae.

Основные принципы организации вирусов:

· неклеточное строение

· отсутствие транскрипционно-трансляционного комплекса

· у вирусов нет органелл, ответственных за получение энергии

· всегда только один тип нуклеиновой кислоты: РНК или ДНК.

· неинтегральный способ репродукции

Самый крупный – вирус оспы Ø 300-450нм

Самый мелкий - вирус ящура Ø ~ 27 нм

Систематика вирусов

Царство вирусов разделено на семейства.

Названия сем. заканчиваются на: – viridae

сем. Picorna viridae

сем. Rhabdo viridae

Для вирусов человека и животных внутри семейства существует деление на рода.

Родовое название заканчивается: – virus

род Influenzа virus – вирус гриппа

род Aphtho virus – вирус ящура

Основы классификации вирусов

· в клетках любых живых организмах:

· прокариот (археев и бактерий)

· растений, водорослей, грибов

· животных и человека

· взаимодействуют с живыми организмами на разных уровнях:

o Клетка

o Орган

o Организм (м.б. весь)

o Популяция

Классификация. Тип строения вириона и механизм взаимодействия с клеткой-хозяином

· Бактериофаги - инъекция НК в бактериальную клетку, вирус внутрь не проникает.

· Вирусы растений - заражение через ранки или при укусе насекомых

· Вирусы человека и животных -эндоцитоз

Классификация. Характеристика природы хозяина

· Естественные хозяева- вирус натуральной оспы

· сем. Poxviridae

· Случайные хозяева - вирус Эбола

· (сем. Filaviridae).