IV. Решите задачи

Тема 2. Белки

I. Ответьте на следующие вопросы.

1. Каковы доказательства полипептидной теории строения белковой молекулы?

2. Какова последовательность операций, лежащая в основе расшифровки первичной структуры белка традиционными методами?

3. Какие ферменты используют при расшифровке первичной структуры белка?

4. Каково тонкое строение пептидной связи (длина связи, вид сопряжения, копланарность, транс-конфигурация)?

5. Каковы параметры а-спирали (шаг спирали, число аминокислотных остатков в витке, высота аминокислотного остатка, период идентичности)?

6. Что представляет собой β-структура полипептидной цепи? Каким образом ориентированы водородные связи, стабилизирующие а-спирали и β-слои, относительно оси белковой молекулы?

7. Каков перечень аминокислот, радикалы которых участвуют в образовании ковалентных, водородных, ионных связей и гидрофобных взаимодействий при формировании третичной структуры белка?

8. Какие типы взаимодействий способствуют соединению протомера в мультимер?

II. Напишите структурные формулы нижеперечисленных соединений: •

1) А) лей-тре-глу-три-арг-фен;б)асп-сер-тир-гли-фен-мет

2) иле-ала-тир-фен-мет-асп-лиз;б)гли-гис-ала-тир-асн-иле

3) пептидов, образующихся при действии на каждое из указанных выше соединений а)трипсина б) химотрипсина.

III. С использованием структурных формул всех компонентов осуществите нижеперечисленные превращения:

карбоксипептидаза

1) ала - фен - гис - арг - мет - глу – лиз → А +BrCN + H₂O →Б

аминопептидаза

2) лей - тре - асп - мет - три – вал → А +BrCN + H₂O →Б

3) ала-ваг-цис-гис+ НСООН₂О₂ →

+C₆H₅N=С=S;pH8-9→ А

IV. Решите задачи.

1. Тетрапептид содержит остатки валина, пролина, аргинина и глицина. В результате реакции тетрапептида с фенилизотиоцианатом и последующего гидролиза промежуточного производного пептида получен фенилтиогидантоин глицина; обработка пептида трипсином дает два соединения, одно из которых окрашивается нингидрином в сине-фиолетовый, а другое — в желтый цвет. Какова первичная структура тетрапептида?

3. Вычислите длину (в нм) полипептидной цепи, состоящей из 159 аминокислотных остатков при условии, что она спирализована на 40 %.

4. Определите долю спиральной конфигурации в белковой молекуле, содержащей 124 аминокислотных остатка, если ее длина равна 40,2 нм.

5. Белковая часть вируса табачной мозаики состоит из 2130 субъединиц с молекулярной массой 17 500 каждая. Вычислите общую длину всех полипептидных цепей вирусной частицы, если доля спиральной конфигурации каждой субъединицы равна 30 %.

7. Какие взаимодействия возможны на контактных участках субъединиц, содержащих аминокислоты: а) вал, тре, асп, три, лей, арг; б) лиз, ала, гис, сер, глу, фен при формировании четвертичной структуры белка?

8. С помощью каких методов можно разделить на индивидуальные составляющие смесь белков, характеризующуюся следующим значением молекулярных масс (М_r, Da) и изоэлектрических точек (ИЭТ) компонентов?

9. Рассчитайте массу гемоглобина, если ω(Fe)=0,34%

Поиск по сайту: